Die Substanzwert Methode bewertet die im Unternehmen eingesetzten Faktoren einzeln. Deshalb bleiben Kombinationseffekte Effekte aus Organisationslösungen, die erst im Mieteinandet von Mensch Infrastruktur und Maschine entstehen) unberücksichtigt. Erhebliche Bewertungsschwierigkeiten treten bei immateriellen Vermögensgegenstände auf die in den Geschäften oder Firmenwert eingehen.